luni, 10 noiembrie 2014

Foarte multe gene implicate in declansarea autismului



Zeci de gene, asociate cu autismul într-o nouă cercetare. Funcțiile unor gene nou-identificate converg în câteva procese biologice importante
de Pete Farley

Două studii genetice majore despre autism, conduse în parte de către oamenii de știință de la UC (University of California) San Francisco și implicând mai mult de 50 de laboratoare de peste tot din lume, au angajat de curând zeci de gene în această tulburare. Cercetarea arată că mutații rare în aceste gene afectează rețelele de comunicare din creier și compromit mecanisme biologice fundamentale ce guvernează dacă, unde și cum sunt activate genele în ansamblu.
Cele două noi studii, publicate în ediția online în avans a revistei „Nature” pe 29 octombrie 2014, au relaționat mutațiile din mai mult de o sută de gene cu autismul. Șaizeci dintre aceste gene au întrunit un prag de „mare certitudine”, indicând că există șanse mai mari de 90% ca mutațiile din aceste gene să contribuie la riscul de autism.
Majoritatea mutațiilor identificate în noile studii sunt mutații de novo (lat.: din nou, iarăși), însemnând că ele nu sunt prezente în genomurile părinților neafectați, însă apar spontan într-un singur spermatozoid sau ovul chiar înainte de conceperea unui copil.
Genele angajate în noile studii se încadrează în trei clase mari: sunt implicate în formarea și funcționarea sinapselor, care sunt locuri ale comunicării celulare nervoase în creier; reglează, printr-un proces numit transcripție, modul în care instrucțiunile din alte gene sunt retransmise la mașinăria producătoare de proteine din celule; și afectează modul în care ADN-ul este „înfășurat” și „împachetat” în celule într-o structură cunoscută drept chromatin. Deoarece modificările structurii chromatin sunt cunoscute ca determinând schimbări în modul în care sunt exprimate genele, mutațiile ce modifică chromatinul, ca și cele care afectează transcripția, se presupune că ar afecta activitatea a multe gene.
Unul dintre noile studii ale „Nature” a folosit date de la Simons Simplex Collection (SSC), o bancă permanentă de mostre DNA de la aproape 3.000 de familii, creată de Simons Foundation Autism Research Initiative. Fiecare familie SSC are un copil afectat de autism, părinți neafectați de această tulburare și, într-o proporție considerabilă, frați neafectați. Al doilea studiu a fost condus sub auspiciile Autism Sequencing Consortium (ASC), inițiativă sprijinită de Institutul Național de Sănătate Mentală [din SUA] ce le permite oamenilor de știință de peste tot din lume să colaboreze la ample studii genomice care nu ar putea fi realizate de laboratoare individuale.
„Înaintea acestor studii, numai unsprezece gene ale autismului fuseseră identificate ca prezentând mare certitudine, iar acum am mărit de mai mult de patru ori numărul lor”, a declarat Stephan Sanders, PhD, profesor asistent de psihiatrie la UCSF, co-prim autor la studiul SSC și coautor la studiul ASC. Bazându-se pe evoluțiile recente, Sanders estimează că descoperirea de gene va continua într-un ritm accelerat, ajungând chiar la 1.000 de gene asociate, în cele din urmă, cu riscul de autism.
„A existat o mare îngrijorare că 1.000 de gene înseamnă 1.000 de tratamente diferite, dar cred că știrea este mult mai bună decât atât”, a declarat Matthew W. State, MD, PhD, șef de catedră și distins profesor de psihiatrie la UCSF. State s-a numărat printre conducătorii studiului „Nature” care s-a concentrat pe SSC și a fost participant senior la studiul organizat de ASC, al cărui cofondator este. „Există deja dovezi solide că aceste mutații converg într-un număr mult mai mic de funcții biologice cheie. Este nevoie ca acum să ne concentrăm asupra acestor puncte de convergență, pentru a începe să dezvoltăm noi tratamente.”
Autismul, ce este caracterizat prin deficiențe în interacțiunea socială și dezvoltarea limbajului, ca și prin comportamente repetitive și interese limitate, este cunoscut ca având o considerabilă componentă genetică. Însă, până în urmă cu câțiva ani, cercetarea genomică eșuase în a asocia în mod decisiv genele individuale cu această tulburare.
Cele două noi studii scot în evidență factorii ce au schimbat în mod radical acel tablou – a mai spus State. Unul este apariția secvențierii de nouă generație (next-generation sequencing – NGS), care le permite cercetătorilor să citească fiecare dintre „literele” din codul ADN cu o viteză fără precedent. Altul este fondarea SSC; un studiu din 2007 sugerase că mutațiile de novo ar juca un rol semnificativ în riscul de autism, iar SSC a fost conceput anume pentru a ajuta la testarea acestei idei, permițând comparații strânse între copiii cu autism și părinții și frații lor, neafectați. În cele din urmă, inițiative de colaborare precum ASC le permit unor echipe de cercetători de peste tot din lume să conlucreze strâns, punându-și la un loc resursele pentru a crea vaste seturi de date, cu suficientă putere statistică pentru a determina concluzii valide.
Amplele echipe de cercetare din spatele fiecăruia dintre cele două noi studii au folosit o formă de NGS cunoscută ca secvențierea „întregului exom”, o analiză literă-cu-literă exact a porțiunii genomului ce codifică proteinele.
În noiembrie 2013, un studiu condus de A. Jeremy Willsey, absolvent al laboratorului lui State, a arătat că rolurile funcționale ale celor nouă gene prezentând o mare certitudine de risc de autism, ce fuseseră atunci descoperite, convergeau toate asupra unui singur tip de celulă, într-un loc specific din creier, într-un moment anume de pe parcursul dezvoltării fetale. Willsey este coautor la ambele studii „Nature”, despre care State crede că vor accelera în continuare înțelegerea noastră asupra modului în care puzderia de gene implicate în autism afectează traiectorii biologice fundamentale din creier.

„Aceste gene au efecte cu adevărat considerabile”, a spus State. „Faptul că avem acum multe zeci de gene și o cale limpede înainte pentru a mai găsi, poate, sute în plus oferă un fundament incredibil pentru a înțelege biologia autismului și a afla noi tratamente pentru el”.

Contact:

Niciun comentariu:

Trimiteți un comentariu